3 октября 1941 года Приказом НКВД № 001435 Особая группа при НКВД СССР была реорганизована во 2-й отдел НКВД СССР (зафронтовая работа — разведка и диверсии в тылу противника; начальник — старший майор госбезопасности Павел Анатольевич Судоплатов).

Войска Особой группы при НКВД днём ранее 2 октября 1941 года были сведены в Отдельную мотострелковую бригаду особого назначения НКВД СССР (полкового состава), которую напрямую подчинили вышеупомянутому 2-му отделу НКВД СССР (с 18 января 1942 года Приказом НКВД № 00145 — 4-е [диверсионное] управление НКВД СССР). Соединение находилось в непосредственном подчинении у Лаврентия Берии.

Первым командиром Отдельной мотострелковой бригады особого назначения НКВД (ОМСБОН) стал полковник М. Ф. Орлов, до перевода в Войска Особой группы при НКВД занимавший должность начальника Себежского военного училища войск НКВД.

Заместителем командира ОМСБОН был назначен полковник �?. М. Третьяков, военным комиссаром — капитан госбезопасности А. А. Максимов, до этого бывший военным комиссаром 1-й мсбрОН Войск Особой группы при НКВД (в звании старшего лейтенанта госбезопасности).

В состав ОМСБОН войск НКВД СССР входили:

• управление (штаб и политотдел);

• 1-й мотострелковый полк: командир — подполковник Н. Е. Рохлин, но вскоре его сменил полковник В. В. Гриднев, с августа 1942 года — майор Н. К. Самусь (создан на базе 1-й мсбрОН Войск Особой группы при НКВД);

• 2-й мотострелковый полк: командир — майор С. В. �?ванов (создан на базе 2-й мсбрОН Войск Особой группы при НКВД);

• минометная батарея;

• противотанковая батарея;

• инженерно-сапёрная рота (в ряде источников встречается наименование сапёрно-подрывная рота);

• рота парашютно-десантной службы;

• рота связи;

• автомобильная рота;

• школа младшего начсостава;

• подразделения материально-технического обеспечения.

1-й и 2-й мотострелковые полки были четырех- и трехбатальонного состава соответственно; мотострелковые батальоны — трехротного состава; мотострелковые роты имели в своем составе три мотострелковых и пулеметный взвод.

Основу личного состава бригады составляли сотрудники НКВД и НКГБ, военнослужащие Пограничных и Внутренних войск НКВД, а также добровольцы-спортсмены: четыреста студентов и преподавателей Государственного центрального института физической культуры, члены спортивного клуба ЦДКА и общества «Динамо», комсомольцы.

После завершения формирования в состав мотострелковой бригады входило около 25 000 человек, из них 2 тысячи иностранцев, являвшихся политическими иммигрантами и проживавшими в СССР.

В состав соединения входили лучшие советские спортсмены (в том числе чемпионы по боксу — С. С. Щербаков и Н. Ф. Королёв, легкой атлетике — братья Знаменские и А. Х. �?саев, тяжёлой атлетике — Н. �?. Шатов, лыжному спорту — Л. А. Кулакова, и многие другие), впоследствии они стали основой диверсионных формирований, посылаемых на фронт и забрасываемых в тыл врага.

Перед бригадой были поставлены следующие задачи: ведение разведывательных операций против Рейха и его сателлитов, организация партизанской войны, создание агентурной сети на территориях, находящихся под немецкой оккупацией, руководство специальными радиоиграми с немецкой разведкой с целью дезинформации противника.

Во время битвы за Москву ОМСБОН в составе 2-й мотострелковой дивизии особого назначения войск НКВД использовалась на передовой, но и в этот период из ее бойцов формировались боевые группы, забрасываемые во вражеский тыл.

7 ноября 1941 года сводный батальон ОМСБОН участвовал в легендарном параде на Красной площади в Москве; во главе батальона шли командир 2-й мотострелковой бригады особого назначения С. В. �?ванов и комиссар С. Т. Стехов.

В ноябре-декабре 1941 года Сводный (Особый) отряд ОМСБОН НКВД (именовавшийся в приказах Западного фронта — Отряд инженерных войск НКВД) ставил минно-взрывные заграждения и проводил минно-подрывные работы перед наступающим противником на подступах к Москве в полосе вышеупомянутого Западного фронта.

Зимой 1941-1942 годов, мобильные лыжные отряды ОМСБОН провели множество дерзких рейдов и налетов в ближнем тылу противника (отряд № 4/70 «Митя» под командованием Д. Н. Медведева).

С 1942 года основной задачей бригады стала подготовка отрядов для действий в глубоком тылу противника. Уже к началу осени 1942 года в тыл врага было заброшено 58 таких отрядов. Как правило, они превращались затем в крупные партизанские отряды. За время войны было сформировано 212 отрядов и групп общей численностью 7316 человек (отряды «Победители» под командованием всё того же Д. Н. Медведева, и «Ходоки» под командованием Е. �?. Мирковского, партизанская бригада «Неуловимые» под командованием М. С. Прудникова, и др.).

10 июня 1943 года спецгруппа ОМСБОН из отряда «Соколы» из двенадцати человек, в основном спортсменов, приземлилась на парашютах в расположении партизан Крыма. Она занималась диверсионной работой, часть легализовалась и занялась разведывательной деятельностью.

В целом, в результате действий бригады было пущено под откос 1415 вражеских эшелонов с живой силой, техникой, боеприпасами, горючим, а также 5 бронепоездов; уничтожено 1232 паровоза; 13 181 вагонов, платформ и цистерн; 2323 автомашины, тягачей, мотоциклов; подорвано 92,2 км рельсовых путей; взорвано 335 железнодорожных и шоссейных мостов. Движение поездов приостанавливалось более 450 раз.

Было уничтожено 145 танков и бронемашин, сбит 51 самолёт. Выведено из строя около 700 километров кабеля телефонно-телеграфных линий, в том числе до 240 километров кабеля, связывавшего командование немецкого Восточного фронта с гитлеровской ставкой.

Осуществлено более четырехсот других диверсионных актов, в результате которых в частности было взорвано и сожжено 344 промышленных предприятия и склада. Также было проведено 1084 боевых столкновения с противником, разгромлено 122 гарнизона, жандармских и полицейских управлений, комендатур и штабов.

В открытом бою и в результате диверсионных актов было уничтожено 136 130 солдат и офицеров противника. Было ликвидировано 87 видных представителей гитлеровских оккупантов, 2045 фашистских агентов и пособников врага.

За годы войны 7103 военнослужащих ОМСБОН были награждены орденами и медалями, свыше двадцати стали Героями Советского Союза.